Kalajauhon tuotanto suoritetaan yleensä useiden keskeisten prosessien kautta, mukaan lukien kypsennys, puristus, kuivaus, jauhaminen ja varastointi. Vaikka käsittelyn perusperiaate on suhteellisen yksinkertainen, vaihtelut raaka-aineen tuoreudessa, prosessointitekniikassa, laitteissa ja käyttökokemuksessa voivat johtaa merkittäviin eroihin lopputuotteen laadussa.
1. Kypsennyksen jälkeen kalaproteiini koaguloituu, jolloin suuri määrä vettä ja öljyä vapautuu.
2. Kypsennetty kala kuljetetaan sitten rei'itettyyn puristuskammioon, jossa se puristetaan mekaanisesti. Öljyn ja veden nestemäinen seos (kalaliemi) uutetaan, kun taas kiinteä puristuskakku poistetaan ulostuloaukosta. Uutettu kalalipeä erotetaan edelleen kalaöljyksi ja juomavedeksi öljy-veden erotusprosessin avulla.
3. Tikkuvesi kierrätetään takaisin järjestelmään ja sekoitetaan puristuskakun kanssa ennen kuivausvaihetta koko kalajauhon tuottamiseksi. On olemassa kaksi pääkuivausmenetelmää: suora kuivaus ja epäsuora kuivaus. Suorakuivaus voi vaikuttaa merkittävästi tuotteiden laatuun, joten nykyaikaiset järjestelmät ottavat yhä useammin käyttöön höyry-pohjaista epäsuoraa kuivausta tai matalassa-lämpötilassa tapahtuvaa tyhjiökuivausta paremman laadun varmistamiseksi.
4. Lopuksi suuret kalanluot jauhetaan hienoksi jauheeksi ja sekoitetaan kalajauhon kanssa ennen pakkaamista ja varastointia.
